Mörtsjöberget ligger omkring 15 kilometer sydost om Hammerdal. Bergets topp ligger drygt 390 meter över havet och reser sig 90 meter över Mörtsjön och Stor-Mörtsjöflon i norr. Berggrunden består av revsundsgranit som går i dagen i vissa branta bergspartier och i små hällmarkspartier kring Stor-Mörtflon. Jordarten är en moig relativt blockfattig morän, men mindre partier av blockhav förekommer. Närheten till kalkberggrunden i väster medför att moränen till stor del är kalkrik.

Naturreservatet är 218 hektar stort och består dels av ett till stora delar brandpräglat naturskogsområde kring Mörtsjöberget och dels av rikkärret Stor-Mörtflon som ligger på norra sidan av berget. Topologin och geologin är mycket variationsrik vilket, tillsammans med en varierad brandhistoria, medför en stor mångfald av skogstyper och livsmiljöer; från kraftigt brandpräglade tallskogar på tunna jordar till sumpskogar och näringsrika granskogar med få eller inga spår av brand. En del av skogen på berget avverkades för några år sedan. Dessutom genomgick delar av den övriga skogen en kraftigare huggning på 1950-1960-talet, vilket påverkat områdets naturvärden negativt, men då inga riktiga kalytor togs upp finns ändå gamla träd kvar i dessa bestånd. Stor-Mörtflon är ett relativt stort och öppet rikkärr som till viss del kan betecknas som extremrikkärr och hyser mycket höga naturvärden.

Länsstyrelsen i Jämtlands län

Ia, Strikt naturreservat (Strict Nature Reserve)

165,08

0,00

219,12

219,05