Sälsflotten utgörs av ett komplex av många mindre, välavgränsade mossar med eller utan tall och en stor del av våtmarken består av kärr. Mossarna är ofta svagt välvda, lavrika ljungmossar med en hel del höljevegetation. I öster sträcker sig myren ner till Käringsjön med mossepartier. Lissrumsmyren i nordväst är en rismosse med ett lösbottenparti och några gölar.
Östra och norra delen av Sälsflotten består mestadels av kärr med trådstarr, vitag och bladvass. I norra delen öppnar Sälsflotten upp sig till ett stort och relativt artrikt lösbottenområde med svagt utbildade strängar av fastare mark. Skogarna i och kring Sälsflotten består mestadels av tallskog, barrblandskog och ett parti i norr med stor lövskogsinblandning. En del av skogarna är brukade, medan andra är naturskogsartade.

Myren är en värdefull livsmiljö för en mängd fåglar, bl.a. häckar typiska myrfåglar såsom storspov, ljungpipare, grönbena och tofsvipa på Sälsflotten. I länets myrfågelinventering har myren givits ett mycket högt värde (klass II). S

Sälsflotten ingår i myrskyddsplan för Sverige.

Kulturhistoriska värden: I området finns kulturvärden i form av fäbodar och en källa.

Länsstyrelsen i Dalarnas län

Ia, Strikt naturreservat (Strict Nature Reserve)

68,88

14,83

515,91

530,79