Missjö naturreservat är beläget inom en av Sveriges mest finskurna skärgårdar, Sankt Anna. Reservatet sträcker sig från Yttre Olsön i väster ca en landmil österut mot öppna havet där Norrbådarna är de sista skären. Marina miljöer är helt dominerande och landmiljöer upptar bara knappt 10% av reservatet. Till naturreservatets landmiljöer hör värdefulla fågelskär som St. Skorv, Norrbådarna och Sköthällarna men även flera skogklädda öar i de inre delarna. Fågelskären uppvisar en utpräglad ytterskärgårdsnatur med mer eller mindre kala öar där endast enstaka lågvuxen rönn och björk växer.

Missjö naturreservat spänner över skärgårdens vegetationszoner mellan- och ytterskärgård med tyngdpunkt på den senare. Hela reservatet har i den fysiska riksplaneringen angivits vara av riksintresse för naturvården. Med undantag av Yttre Olsön ingår även området i Naturvårds-verkets ¿Nationalparksplan för Sverige¿. Missjöarkipelagen har i en projektrapport 1994 från Nordiska Ministerrådet föreslagits till ett marint naturreservat. Området ingår som en del i ¿BSPA-området¿ S:t Anna. BSPA (Baltic sea protected area) är av regeringen och Helcom (Helsingforskonventionen) fastställda områden kring Östersjön.

Länsstyrelsen i Östergötlands län

Ib, Vildmarksområde (Wilderness Area)

32,10

1 675,46

157,54

1 833,11