Jag har tyvärr ingen aning om vad det beror på men har liknande problem.
Jag noterade redan i min ungdom att skor som gick över fotknölen inte fungerade på min fot, mycket p.g.a. knölen men även för att sådana skor gjorde att mina fötter inte kunde röra sig som de brukar.
För min del blev det inte något stort problem då jag istället valde att vandra i converse skor, vilka kan ses som den tidens barfotaskor. Det var mer utmanande i skol sammanhang när de tvingade på en skridskor, jisses vad ont det gjorde. I vandringssammanhang så fick man en hel del kommentarer om skovalet men det lärde man sig att ignorera, förförra sommaren var första gången någon kommenterade valet på ett intresserad sätt.
Tyvärr är det kanske inte en lösning för dig, att undvika sådana skor, men du är i alla fall inte ensam med problemet.
Vida stövlar fungerade för mig och nu när jag blivit gammal så klarar jag skor som täcker knölen så länge de inte sitter åt där men om de inte är mjuka så får jag ont ändå men det är nog en annan orsak.