Worldfilen säger bara hur kartan ska visas i ett koordinatsystem, inte vilket koordinatsystem som används. Det går i allmänhet inte att 'konvertera' en kartfil från ett koordinatsystem till ett annat bara genom att ändra worldfilen. Det är möjligt att det går att få kartan att passa någorlunda bra i SWEREF99 TM bara genom att definiera en rotation och en translation i worldfilen om den är tillräckligt liten, men många kartprogram klarar inte av rotationer i worldfiler och om kartan är för stor så får du förmodligen ändå förvrängningar.
Om du verkligen vill konvertera kartan (inklusive själva rastret) så är det enklaste förmodligen att använda GDAL och kommandot
gdalwarp -s_srs epsg:3021 -t_srs epsg:3006 -co COMPRESS=JPEG min_karta.jpg min_nya_karta.tif
(EPGS:3021 är RT90 2.5 gon V och EPSG:3006 är SWEREF99 TM)
Men ännu enklare, ifall det är den enda rasterkartan du tänker använda, är att ställa in ditt kartprogram att använda RT90 för kartan istället och låta det konvertera eventuella vektorkartor automatiskt. Det brukar bli bättre än att konvertera raster, man tappar alltid i kvalitet när man konverterar rasterfiler mellan olika koordinatsystem.